如何用BioEdit分析酶切位点从而设计合适引物
的有关信息介绍如下:BioEdit是一个序列编辑器与分析工具软件。功能包括:酶切位点分析、序列编辑、外挂分析程序、RNA分析、寻找特征序列、支持超过20000个序列的多序列文件、基本序列处理功能、质粒图绘制等等。下面我就给大家介绍如何使用BioEdit来查找DNA序列的酶切位点,从而设计合适的引物。
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安装之后,打开软件,显示以下画面:
将序列粘到文本文档中,如:“sequence1”,注意用fasta格式,见下图:
依次点击BioEdit软件的"file>open>"将“文本文档 sequence1”打开:
选中“sequence1”后,选中标题栏中“sequence”>"Nucleic Acid">"Restriction Map"
在新的界面中选择“Generate Map”
在出现的界面中,即是分析得到的酶切位点图,可以显示每个酶切位点在序列中的位置,拖滚动条到最下面,可以看到酶不能切割的酶切位点。